Dnia 2 czerwca 2010 o godzinie 10:44 wybuchł pożar w turbinie 6, zapalił się zbiornik z olejem. Na miejscu pojawiło się 16 jednostek straży pożarnej. W budynku technologicznym, w którym pojawiły się płomienie, odłączono zasilanie. Lekkich poparzeń doznali strażak oraz pracownik; drugi strażak biorący udział w akcji uległ podtruciu. Pożar ugaszono o 11:45, akcja wychładzania zbiornika z olejem zakończyła się o 12.30.
Plany Właściciel elektrociepłowni spółka Orlen Termika planuje budowę na terenie elektrociepłowni nowego bloku gazowo-parowego, co ma umożliwić wyłączenie dwóch bloków węglowych i ograniczenie zużycia węgla z 1,2 do 0,2 mln tony rocznie.
W 2022 roku spółka zrezygnowała z budowy instalacji do współspalania rocznie ok. 90 tys. ton odpadów: biomasy i RDF (ang. Refuse Derived Fuel, odpadów o dużej wartości opałowej).
Kontrowersje
W styczniu 2025 roku spółka przedstawiła projekt "stabilizacji dna rzeki Wisły w rejonie ujęcia wody chłodzącej dla EC Siekierki". Wywołało to sprzeciw wielu organizacji pozarządowych i ekspertów wskazujących, że w