Największy sukces klubowy to zdobycie pucharu Czech w 1998, co pozwoliło wystartować w Pucharze Zdobywców Pucharów w następnym sezonie.
W sezonie 2009/2010 czeskiej ekstraklasy Jablonec finiszował punkt za mistrzami ze Sparty Praga, zaś w kolejnej edycji rozgrywek zajął trzecie miejsce. W 2013 roku po raz drugi w historii wywalczył Puchar Czech, pokonując w finale FK Mladá Boleslav rzutami karnymi i kwalifikując się po raz 6. do europejskich pucharów.
W sezonie 2017/18 po raz 8. dotarli do finału Pucharu Czech, gdzie przegrali ze Slavią Praga 1:3. W tym samym sezonie zajęli w lidze 3. miejsce i zakwalifikowali się po raz 8. do europejskich pucharów.
Ponownie w finale Pucharu Czech byli w sezonie 2025/26, gdzie również ulegli, tym razem zespołowi MFK Karviná.
Jablonec w I lidze czechosłowackiej Sezon M Z R P BZ BS Punkty Miejsce 1974/75 30 12 4 14 28 36 28 11. 1975/76 30 7 10 13 28 51 24 15.
Pierwszoligowi rekordziści klubu Mecze Stan na koniec sezonu 2017/18 1 Luboš Loučka 239 2 Jozef Weber 208 3 Tomáš Michálek 182 4 Tomáš Čížek 163 5 David Lafata 161 Pavel Eliáš 161 7 Roman Skuhravý 150 8 Pavel Jirousek 141 Vít Beneš 141 10 Pavel Pěnička 139