Słowaccy Węgrzy weszli w kadencji 1998–2002 w skład koalicji rządzącej wraz z SDK Mikuláša Dzurindy, SDL i SOP.
W wyborach prezydenckich w 1999 startował wspólny kandydat SDK, SDL, SMK i SOP Rudolf Schuster, który wygrał wybory prezydenckie otrzymując w drugiej turze 57,18% poparcia.
W wyborach parlamentarnych w 2002 partia zdobyła 11,17% i 20 mandatów, co dało jej ponownie czwarte miejsce. Po wyborach tworzyło rządową koalicję ze Słowacką Unią Chrześcijańsko i Demokratyczną Mikuláša Dzurindy, Ruchem Chrześcijańsko-Demokratycznym i Sojuszem Nowych Obywateli.
W wyborach prezydenckich w 2004 startował wspólny kandydat SMK i KDH František Mikloško, który w pierwszej turze dostał jedynie 6,51% poparcia zajmując dopiero piąte miejsce w stawce jedenastu kandydatów.
W wyborach do Parlamentu Europejskiego w 2004 SMK osiągnęła 13,25% głosów, co dało jej piąte miejsce i 2 euromandaty. Partia Węgierskiej Koalicji należy do Europejskiej Partii Ludowej.
W wyborach parlamentarnych w 2006 partia zajęła po raz kolejny czwarte miejsce z poparciem 11,69%, co dało jej znów 20 mandatów. Tym razem SMK znalazła się w opozycji.