Tam też opanował sztukę kręcenia filmów techniką poklatkową, którą zastosował później w teledyskach: „Sober”, „Prison Sex”, „Stinkfist” i „Ænema”.
Po przeprowadzeniu się na stałe do Los Angeles, Jones zaczął projektować i wykonywać makijaże sceniczne dla różnych zespołów, między innymi Green Jelly, gdzie na perkusji grał Danny Carey, późniejszy perkusista Tool. Od czasu do czasu pracował też w komercyjnym salonie makijażu i charakteryzacji aktorów.
W 1990 roku wspólnie z Jamesem Keenanem podjął decyzję o założeniu zespołu Tool. W 1992 ukazała się pierwszy minialbum zespołu pt. Opiate, na którym Jones zagrał na gitarze.
Praca artystyczna Przez około dwa lata pracował w sklepie Ricka Lazzariniego „The Character Shop” pracując przy programie telewizyjnym Monsters. Tam też zaprojektował i wykonał makijaż dla Grim Reapera i głowę zombie na gwoździu, które później zostały wykorzystane w filmie Pogromcy Duchów 2. Wykonał także charakteryzację Freddiego Krugera w piątej części Koszmaru z ulicy Wiązów. Pracował też przy charakteryzacji do filmu Edward Nożycoręki.