W 1999 roku auto przeszło face lifting. Zmieniono m.in. nadwozie oraz wnętrze pojazdu, a do gamy nadwoziowej wprowadzono wersję kombi. W tym samym roku face lifting przeszedł też Mégane Scénic, który otrzymał już tylko pojedynczą nazwę Scénic.
Silniki Phase I Benzynowe SilnikPojemnośćskokowa [cm³]Moc maksymalna[KM] ( [kW] ) przy obr./minMaks. moment obrotowy[Nm] przy obr./minUkład i liczbacylindrówUkład rozrządu/liczba zaworówPrzyspieszenie (s)0–100 km/hPrędkość maksymalnakm/hSpalanie (l/100 km)średnie1.4 Eco139070 (51)/6000105/4000R4OHC/814,51687,11.4e139075 (55)/5500114/4250R4OHC/813,81707,31.6159875 (55)/5000130/3400R4OHC/812,91757,51.6e159890 (66)/5000137/4000R4OHC/811,51847,51.6Aut.159890 (66)/5000137/4000R4OHC/813,71708,52.01998113 (83,5)/5400168/4250R4OHC/89,71978,92.0Aut.1998113 (83,5)/5400168/4250R4OHC/810,91979,22.0 16VF7R1998147 (108)/6000185/4500R4DOHC/167.82269,1 W Coupé i Cabrio nie stosowano silników 1.4 i 1.6 75KM, z kolei tylko w tych dwóch wersjach był dostępny silnik 2.0 16V. Zostały też wyprodukowane nieliczne egzemplarze typu hatchback z tym silnikiem. Wysokoprężne SilnikPojemnośćskokowa [cm³]Moc maksymalna[KM] ( [kW] ) przy obr./minMaks.