Zakon stał się bardzo popularny w USA, gdzie przystąpiło do niego ponad 2000 kawalerów.
Jednocześnie powstawało też wiele organizacji podszywających się pod zakon.
Obecnie wszystkie katolickie stowarzyszenia kawalerów maltańskich są oficjalnie częścią zakonu, zaś protestanckie stowarzyszenie angielskie i niemieckie funkcjonują niezależnie, ale stale współpracują i wymieniają doświadczenia z zakonem katolickim.
Zakon w swojej części katolickiej liczy dzisiaj ok. 10 tys. członków, zrzeszonych w sześciu wielkich przeoratach, 4 subprzeoratach i 45 związkach narodowych.
Od 1920 jest nadawany Order Zasługi Zakonu Maltańskiego (Order Pro Merito Melitensi), który mogą otrzymywać również niekatolicy.
Ustrój polityczny thumb|Kraje, z którymi zakon utrzymuje stosunki dyplomatyczne Zakon stanowi suwerenny podmiot prawa międzynarodowego. W 2025 r. miał ustanowione stosunki dyplomatyczne ze 110 państwami świata. W 1994 roku zakon uzyskał status oficjalnego stałego obserwatora przy ONZ.