Botew po kilkunastu słabszych sezonach, kiedy najczęściej był w środku tabeli, powrócił do bułgarskiej czołówki na początku lat 80. W ciągu kolejnych piętnastu lat – od 1980 do 1995 roku – ośmiokrotnie zajmował trzecie miejsce w tabeli, raz (1986) zdobył wicemistrzostwo kraju, wygrał Puchar Armii Sowieckiej (1981) i wielokrotnie awansował do finału Pucharu Bułgarii. Napastnik Georgi Sławkow został najlepszym strzelcem Europy w sezonie 1980-81 (31 goli w 21 meczów). W tym okresie Botew (Trakia) wygrywa swoje mecze z Barceloną (1:0, 1981) i Bayern M. (2:0, 1984) dla Pucharu Zdobywców Pucharów.
Później najczęściej rozczarowywał swoich kibiców z powodu słabego panowania prezesa D. Hristołowa. W sezonie 2000-2001 po raz pierwszy od 1954 roku spadł do II ligi. Do ekstraklasy powrócił już rok później, ale na krótko. Ponownie w I lidze występował od 2005 do 2010 roku.
Podczas przerwy zimowej w sezonie 2009/2010 klub został relegowany z rozgrywek z powodu długów przekraczających 2 miliony lew. Nowa drużyna rozpoczęła rozgrywki od III poziomu rozgrywkowego w Bułgarii, gdzie podczas sezonu 2010-11 bez żadnej konkurencji zwyciężył w swojej grupie.