Mieszkał z żoną w dzielnicach Bronx i Hell’s Kitchen w skrajnym ubóstwie. Podejmował się drobnych prac, próbował sprzedawać opowiadania do gazet i czasopism. W 1900 r. ukończył pisać autobiografię Many Parts. W 1905 r. poznał reportera Theodore Dreisera, który stał się jednym z jego nielicznych przyjaciół. Dzięki jego staraniom w 1919 r. wydana została książka Forta Księgę rzeczy wyklętych (The Book of the Damned) w której zamieścił najbardziej zadziwiające historie, o jakich czytał i słyszał.
Większość czasu spędzał w New York Public Library, gdzie studiował prace naukowe i sporządzał notatki. Z czasem jednak rozczarował się nauką, spalił ok. 25 000 notatek i zaczął przeszukiwać gazety i czasopisma w poszukiwaniu rzeczy niewyjaśnionych i tajemniczych. Na ich podstawie opracował teorię istnienia UFO, pisał artykuły o duchach i teleportacji. W 1914 r. napisał dwie książki X i Y. Pierwsza mówiła o istnieniu cywilizacji marsjańskiej i jej wpływie na życie mieszkańców Ziemi, w drugiej Fort miał przedstawić dowody na istnienie nieznanej cywilizacji na biegunie południowym. Żaden wydawca nie był zainteresowany opublikowaniem tych pozycji. Fort w konsekwencji spalił rękopisy obu książek.