Po uporaniu się z problemami, Electric Wizard wreszcie nagrał i wydał swój trzeci album, Dopethrone, w 2000 roku. Styl tego albumu rozwinął się na bazie kompozycji znajdujących się na Come My Fanatics... i popchnął on doom metal w nowe muzyczne obszary. Następny album grupy, zatytułowany Let Us Prey, został wydany w 2002 roku. To najbardziej eksperymentalne nagrania Electric Wizard, zawierające agresywne dźwięki zbliżone do sludge metalu. Po wydaniu albumu zespół rozpoczął niefortunne tournée po Ameryce Północnej, które doprowadziło do spięć między muzykami. Koncert finałowy trasy został ogłoszony jako ostatni występ Electric Wizard w ogóle, ale na szczęście okazało się to przedwczesną deklaracją. Electric Wizard powrócił następnie do Wielkiej Brytanii na tournée z Cathedral, podczas którego miejsce Greeninga zajął Justin Greaves (z Iron Monkey). W kwietniu 2003 roku Greening i Bagshaw odeszli z zespołu, aby założyć Ramesses.