W lutym 2014 roku Senna przedłużył umowę z amerykańskim klubem do lipca 2015 roku.
Kariera reprezentacyjna Marcos Senna w reprezentacji Hiszpanii zadebiutował dnia 1 marca 2006 roku w wygranym 3:2 meczu towarzyskim z reprezentacją Wybrzeża Kości Słoniowej rozegranym na Estadio José Zorrilla w Valladolid. Trzy miesiące później został powołany na Mistrzostwa Świata 2006 w Niemczech.
W 2008 roku został powołany przez Luisa Aragonésa na Mistrzostwa Europy 2008 w Austrii i Szwajcarii. Senna odegrał na tamtym turnieju ogromną rolę, przyczyniając się w dużej mierze do zdobycia przez reprezentację mistrzostwa Europy.
Dnia 10 września 2008 roku strzelił swojego jedynego gola w reprezentacji Hiszpanii w wygranym 4:0 meczu kwalifikacyjnym mistrzostw świata 2010 przeciwko reprezentacji Armenii rozegranym na Estadio Carlos Belmonte w Albacete.
Ostatni mecz w reprezentacji Hiszpanii rozegrał dnia 3 marca 2010 roku w wygranym 2:0 meczu towarzyskim z reprezentacją Francji rozegranym na Stade de France w Saint-Denis. Marcos Senna łącznie w reprezentacji Hiszpanii rozegrał 28 meczów i strzelił 1 bramkę.