Powierzchnia rezerwatu jest pofalowanym terenem morenowym z licznymi, podmokłymi zagłębieniami. Atrakcją rezerwatu jest dolina rzeki Łyny. Na odcinku między jeziorem Ustrych a wsią Ruś rzeka ma charakter podgórski. W Lesie Warmińskim znajdują się jeziora śródleśne oraz kurhany sprzed 2000 lat.
W 2013 roku w pobliżu wypływu rzeki Łyny z jeziora Ustrych odsłonięto pamiątkowy głaz z napisem „Rezerwat przyrody Las Warmiński im. prof. Benona Polakowskiego”Kostrzewska J., 2013, Upamiętniono wybitnego botanika. Głos Eko, nr 64, Gazeta Olsztyńska, 26.07.2013 i jednocześnie zmieniono nazwę rezerwatu w celu upamiętnienia prof. Polakowskiego – wybitnego polskiego botanika, zasłużonego dla ochrony przyrody Warmii i Mazur.
Flora, mykobiota i fauna W Lesie Warmińskim znajduje się bogata roślinność, liczne starodrzewy, wśród których przeważa sosna. Najstarsze drzewostany sosnowe mają ponad 200 lat. Drzewo to miejscami osiąga do 38 m wysokości i 100 cm pierśnicy. Niektóre egzemplarze dębu osiągnęły 350 lat. Szereg drzew jest pomnikami przyrody, do najciekawszych należą: „Dąb Napoleona” oraz wiekowy cis o formie krzaczastej i wysokości ok. 3 m. Oba wymienione egzemplarze uznano za pomniki w 1952 r. Las posiada bogate podszycie, z wieloma gatunkami roślin objętych ochroną.