W 2012 roku przewiozły one 11 375 osób i 270 rowerów, a w roku 2013, tylko w okresie od 1 maja do 20 sierpnia ponad 20 tysięcy pasażerów oraz 354 rowery.
W 2015 połączenie do Narodowego Centrum Żeglarstwa zostało wydłużone o dodatkowy przystanek w Sobieszewie, przy jednoczesnym zachowaniu dotychczasowej przystani końcowej. Rok później linię F5 wydłużono do Brzeźna. Wtedy też zmieniono trasę linii F6 na Targ Rybny – Narodowe Centrum Żeglarstwa – Sobieszewo. Dalsze zmiany miały miejsce w 2018, wraz z zakończeniem projektu „Program ożywienia dróg wodnych w Gdańsku”. Wtedy to zaprzestano obsługi części przystanków tramwaju wodnego (m.in. na Stogach). Dodatkowo uruchomiono przedsprzedaż internetową (do 50% miejsc na statku) oraz sprzedaż przekąsek na pokładzie statku. Ponadto kursowanie statków na odcinkach do Brzeźna i Sobieszewa zapoczątkowano już 1 maja i realizowano do 16 września, ale do 22 czerwca i od 3 września linie F5 i F6 funkcjonowały wyłącznie w weekendy.