Struktura katalogów Wszystkie pliki i katalogi znajdują się w katalogu głównym „/”, nawet jeśli są przechowywane na innych dyskach fizycznych. Niektóre z tych katalogów mogą być obecne tylko po instalacji konkretnego oprogramowania np. X Window System (zwane dalej po prostu „X”).
KatalogOpis/bin/Podstawowe pliki wykonywalne () dostępne dla wszystkich użytkowników (np. cat, ls, cp)./boot/Pliki programu rozruchowego (np. kernel, initrd)./dev/Pliki urządzeń (; np. /dev/null)./etc/Pliki konfiguracyjne./etc/opt/Pliki konfiguracyjne dla katalogu /opt/. /etc/X11/Pliki konfiguracyjne X w wersji 11. /etc/sgml/Pliki konfiguracyjne dla SGML. /etc/xml/Pliki konfiguracyjne dla XML./home/Katalogi domowe użytkowników ()./lib/Biblioteki () dla programów z katalogów /bin/ i /sbin/./mnt/Punkt montowania () innych niż natywny systemów plików./media/Punkty montowań dla nośników wymienialnych (; np. CD-ROMów) (pojawiło się w FHS-2.3)./opt/Opcjonalne aplikacje./proc/Wirtualny system plików proc informujący o stanie systemu i poszczególnych procesów, w większości pliki tekstowe (np. uptime, network)./root/Katalog domowy użytkownika root./sbin/Pliki wykonywalne do zarządzania systemem (;