12 sierpnia 2009 rzecznik prasowy Ekstraklasy Adrian Skubis poinformował, że w sezonie 2009/2010 rozgrywki o Puchar Ekstraklasy nie zostaną zorganizowane. Głównym powodem decyzji był brak sponsora rozgrywek, a także brak zainteresowania ze strony jakiejkolwiek stacji telewizyjnej, która przeprowadziłaby transmisje z meczów PucharuSport.pl.. Kluby Ekstraklasy ustaliły, że rozgrywki o Puchar Ekstraklasy nie będą reaktywowane również od sezonu 2010/2011, co definitywnie przekreśla możliwość reaktywacji tych rozgrywek w przyszłości.
Zasady Zgodnie z regulaminem turnieju, w rozgrywkach mogły uczestniczyć 16 klubów Orange Ekstraklasy sezonu 2006/2007. W I rundzie zostały one podzielone na cztery 4-zespołowe grupy, z których do etapu pucharowego (II rundy – ćwierćfinału) awansowały po 2 najlepsze drużyny każdej z grup.
W odróżnieniu od rozgrywek ligowych, dopuszczone było wykonanie 6 zmian w trakcie meczu (3 zmiany w trakcie trwania meczu oraz dodatkowo 3 zmiany w trakcie przerwy) oraz możliwość wystawienia w nich zawodników nie zgłoszonych do rozgrywek ligowych lub polskich zawodników przebywających w danym klubie na testach.