Podczas okupacji przebywał w Lipnicy, gdzie działał w Armii Krajowejczasbochenski.pl - Józefina Ledóchowska-matka świętych [dostęp 2011-12-07]. Przybrawszy pseudonim „Krak”, prowadził tajne szkolenie wojskowe dla partyzantów. Aresztowany przez Niemców, trafił do obozu koncentracyjnego Gross-Rosen. 9 marca 1945 zmarł w KL Mittelbau-Dora (nr obozowy 113195)- Ignacy Kazimierz hr. Halka-Ledóchowski z Leduchowa h. Szaława [dostęp 2021-09-02].
24 listopada 1903 w Krakowcu ożenił się z Pauliną Łubieńską (1880–1951), z którą miał czworo dzieci: Jadwigę (1904–1994), Marię Teresę (1906–1992) po mężu Tyszkiewicz, Józefę Marię (1908–1983) i Włodzimierza Mariana Franciszka Stanisława Ignacego (1910–1987), podporucznika artylerii rezerwy Wojska Polskiego.
Awanse porucznik – starszeństwo z 1 września 1892 nadporucznik – starszeństwo z 1 maja 1896 kapitan 2 klasy – starszeństwo z 1 maja 1902 kapitan 1 klasy – 1906 ze starszeństwem z 1 maja 1902 major – starszeństwo z 1 listopada 1913 podpułkownik – starszeństwo z 1 września 1915 pułkownik – 1918