Po wykonaniu programu misji Atlantis wylądował pomyślnie w bazie lotniczej Edwards w Kalifornii.
STS-82 (Discovery F-22); 11 lutego 1997 Joseph Tanner rozpoczął swój drugi lot w kosmos. Podczas lotu promu Discovery oznaczonego jako STS-82 tak jak poprzednio był specjalistą misji (MS-1). Dowódcą wyprawy był Kenneth Bowersox, pilotem Scott Horowitz, a specjalistami misji: Steven Hawley (MS-2), Gregory Harbaugh (MS-3), Mark Lee (MS-4) i Steven Smith (MS-5). Celem ekspedycji była naprawa teleskopu Hubble’a (HST – Hubble Space Telescope). 13 lutego załoga przechwyciła HST na orbicie i zakotwiczyła go w ładowni promu. Astronauci wychodzili na zewnątrz wahadłowca w celu naprawy uszkodzonych elementów HST aż pięć razy. Joseph Tanner oraz Gregory Harbaugh uczynili to dwukrotnie: 15 grudnia pracowali przy HST przez blisko 7,5 godziny, a 17 grudnia przez 6,5 godziny. Po pomyślnie wykonanym remoncie teleskop został ponownie umieszczony na orbicie 19 grudnia. Załoga STS-82 powróciła na Ziemię 21 grudnia 1997, lądując pomyślnie w Centrum Kosmicznym imienia Johna F. Kennedy’ego.