W kolejnych latach utworzono sieć bibliotek lekarskich na terenie całego kraju, zabezpieczano tysięcy zbiorów naukowych i księgozbiorów oraz wznowiono działalność naukowo-wydawniczą w sektorze czasopism i książek medycznych.
5 listopada 1949 r. na mocy zarządzenia ówczesnego Ministra Zdrowia dra Tadeusza Michejdy, Lekarski Instytut Naukowo-Wydawniczy został przekształcony w samodzielny Państwowy Zakład Wydawnictw Lekarskich (PZWL).
W 1993 r., po przemianach ustrojowych, państwowe przedsiębiorstwo przekształciło się w prywatną spółkę pracowniczą, która w 1998 r. stała się częścią Grupy PWN (obecnie sp. z o.o.).
Pierwsza siedziba wydawnictwa znajdowała się w budynku Państwowa Szkoła Higieny (PZH) przy ul. Chocimskiej 24 w Warszawie.
Działalność wydawnicza PZWL wydaje publikacje medyczne, w tym: podręczniki akademickie dla studentów uczelni medycznych, podręczniki dla uczniów średnich szkół medycznych, literaturę dla lekarzy i personelu medycznego, encyklopedie, leksykony, monografie, książki popularnonaukowe i poradniki oraz publikacje z dziedzin okołomedycznych, takich jak: biologia, botanika, zoologia.