W 1992 roku Radio Olsztyn nadawało całą dobę własny program. 1 grudnia 1993 roku nastąpiło przekształcenie państwowej jednostki organizacyjnej w spółkę prawa handlowego. Dało to rozgłośni samodzielność prawną. W 2001 roku Radio Olsztyn uzyskało zgodę KRRiTV na podział pasma i rozpoczęło nadawanie regularnych audycji w języku ukraińskim. Od kwietnia nadawane są także audycje w języku niemieckim.
29 grudnia 2023 roku, Minister Kultury i Dziedzictwa Narodowego, jako reprezentant Skarbu Państwa posiadającego 100% akcji, kontynuując proces likwidacji 17 spółek regionalnych rozgłośni Polskiego Radia, powołał likwidatora dla spółki „Radio Olsztyn” SA – został nim Artur Lewandowski.
Słuchalność Według badania Radio Track (wykonane przez Millward Brown SMG/KRC) za okres listopad-kwiecień 2021/2022, wskaźnik udziału w rynku słuchalności Polskiego Radia Olsztyn wyniósł 7,7 proc., co dało tej stacji 5.