Luty 1997: Rada Miasta Gdyni wyróżniła szkołę Medalem im. Eugeniusza Kwiatkowskiego za wybitne zasługi dla Gdyni. Złoty medal na międzynarodowej olimpiadzie filozoficznej – Leszek A. Kołodziejczyk. Uzyskuje on także najlepszy wynik na maturze IB na świecie (koordynator programu IB – Peter Senn).
1998: Pierwsze miejsce III LO w rankingu szkół opracowanym przez Polski Komitet ds. UNESCO. Kwiecień: Wizyta w szkole Mirosława Handkego – Ministra Edukacji Narodowej. Złoty medal na międzynarodowej olimpiadzie matematycznej – Marcin Stefaniak z klasy IV M. Najlepszy wynik na maturze IB na świecie – Iga Korneta. Złoty medal na międzynarodowej olimpiadzie filozoficznej – Piotr Labenz z kl. IV IB. l września: Wizyta w liceum premiera rządu RP Jerzego Buzka. Podpisanie umowy o współpracy z Uniwersytetem Gdańskim.
1999: Kwiecień: podczas Jubileuszowej XXV Ogólnopolskiej Olimpiady Geograficznej odwiedzili szkołę marszałek Sejmu RP – Maciej Płażyński oraz dowódca Marynarki Wojennej – admirał floty Ryszard Łukasik. Maj: Michał Miąskiewicz z kl. III IB został wybrany Przewodniczącym Rady Młodych Europy na uroczystym posiedzeniu przedstawicieli młodzieży z państw Rady Europy w Strasburgu. l września: wizyta w liceum prezydenta Niemiec Johannesa Raua oraz prezydenta RP Aleksandra Kwaśniewskiego.