10 czerwca 1998 papież Jan Paweł II mianował go biskupem pomocniczym diecezji zamojsko-lubaczowskiej ze stolicą tytularną Bassiana. Święcenia biskupie otrzymał 4 lipca 1998 w katedrze zamojskiej. Udzielił mu ich arcybiskup Józef Kowalczyk, nuncjusz apostolski w Polsce, z towarzyszeniem Józefa Michalika, arcybiskupa metropolity przemyskiego, i Jana Śrutwy, biskupa diecezjalnego zamojsko-lubaczowskiego. Jako zawołanie biskupie przyjął słowa „Veni, Creator Spiritus” (O Stworzycielu Duchu, przyjdź). W 1998 został mianowany wikariuszem generalnym, moderatorem kurii diecezjalnej, przewodniczącym rady duszpasterskiej oraz członkiem kolegium konsultorów i rady kapłańskiej, w latach 1998–2014 przewodniczył wydziałowi duszpasterskiemu kurii. W latach 1998–1999 pracował jako proboszcz parafii św. Krzyża w Zamościu, a w latach 1999–2000 był dyrektorem Katolickiego Radia Zamość. W 1999 został kanonikiem gremialnym kapituły katedralnej, w 2001 objął w niej funkcję dziekana. Od 3 lutego 2012, po nominacji Wacława Depy na urząd arcybiskupa metropolity częstochowskiego do 11 sierpnia 2012, kiedy to urząd objął kolejny biskup zamojsko-lubaczowski Marian Rojek, zarządzał diecezją jako jej administrator.