Na tej samej platformie powstały także Yaris czwartej generacji i Yaris Cross.
Wersja koncepcyjna AYGO X prologue to koncept crossovera segmentu A, z dwukolorowym nadwoziem z lakierem Sparkling Chilli Red. Koncept został zaprojektowany przez europejskie studio projektowe Toyoty ED2.
Aygo X - wersja produkcyjna Toyota potwierdziła jego wprowadzenie na rynek 5 października 2021 roku. Samochód został pokazany 5 listopada 2021 roku. Przyjmowanie rezerwacji w Polsce ruszyło w grudniu 2021 roku. Jest produkowany w fabryce Toyota Motor Manufacturing Czech Republic w Kolinie. Produkcja rozpoczęła się w kwietniu 2022 roku.
"X" w nazwie jest czytany jako "Cross" i oznacza crossovera, tak jak w przypadku Yarisa Cross i Corolli Cross. Jednocześnie nawiązuje do Aygo poprzedniej generacji, który miał znak "X" wpisany w stylistykę przodu.
Aygo X otrzymał benzynowy silnik 1,0 l 1KR-B52 o mocy 72 KM, znany z Aygo 2. generacji. W standardzie jest 5-stopniowa skrzynia manualna.
W połowie 2025 roku producent zmodernizował Aygo X. Pojazd otrzymał zmodyfikowany przód, agresywny grill oraz ostrzejsze reflektory.