W czasie wojny uczestniczyła w działalności konspiracyjnej. Pracowała w kawiarni „Adria” (przy ul. Moniuszki), gdzie mieścił się punkt kontaktowy. Pracowali tutaj dziennikarze międzywojennego tygodnika „Prosto z Mostu” Stanisława PiaseckiegoW. Krajewski, Adwokat Jadwiga Rutkowska (1910-1994), „Palestra” 38, 1994, nr 11 (443), s. 223.. W wyniku aresztowania 5 grudnia 1940 znalazła się w więzieniu na Pawiaku, skąd została zwolniona 2 września 1941. Przed wybuchem powstania warszawskiego brała udział w rozpoznaniu terenu i przygotowaniu powstańczej Kwatery Głównej szefostwa Tajnych Wojskowych Zakładów Wydawniczych. Odpowiadała za funkcjonowanie 10 drukarni w czasie walk powstańczych. Działała pod pseudonimem „Katarzyna”.
Po upadku powstania warszawskiego była administratorem Zakładu dla wysiedlonych starców i chorych w Poroninie (od października 1944 do kwietnia 1945. W maju tego samego roku podjęła pracę w Polskim Czerwonym Krzyżu (referent, a potem stanęła na czele Wydziału Ogólnego i Organizacyjnego Zarządu Głównego PCK w Gdańsku. W PCK pracowała do stycznia 1948W. Krajewski, Adwokat Jadwiga Rutkowska (1910-1994), „Palestra” 38, 1994, nr 11 (443), s. 224..