Decyzją Rady Ministrów z 7 lipca 1945 wraz z kilkunastoma powiatami ziem zachodnich Kostrzyn został włączony do województwa poznańskiego. W 1946 miasto liczyło 634 mieszkańców. Początkowo Kostrzyn był miastem zamkniętym, jedynymi mieszkańcami byli kolejarze i celnicy. W 1954 rozpoczęła się budowa największej wówczas w Polsce fabryki papieru i celulozy – Zakładów Celulozy i Papieru (oddana do użytku 19 grudnia 1958Władysław Kurkiewicz „25 lat Polski Ludowej“ Ludowa Spółdzielnia Wydawnicza 1971, s. 198).
25 maja 1965 w granicach miasta nad Odrą rozbił się MiG-21 sił powietrznych NRDKatastrofa wojskowego MiG-a w Kostrzynie. To sprawa, o której miało być cicho. Są tacy, którzy ją pamiętają.