Istnieje również wersja, że został skrytobójczo zamordowany przez NKWD (we własnej sypialni)Okoliczności śmierci Ordżonikidzego, komunikat oficjalny, inne wersje, losy rodziny opisuje R. Conquest, Wielki Terror, Warszawa 1997, , s. 191–195.Bliski przyjaciel wdowy po Ordżonikidze twierdzi, że była ona zdania, iż jej mąż nie zginął z własnej ręki, i że w godzinie jego śmierci widziała jakichś ludzi uciekających z ich domu przez trawnik. Funkcjonariusz partii kaukaskiej, który był w owym czasie w Moskwie utrzymuje, że Stalin posłał do Ordżonikidzego kilku tajniaków, którzy postawili go przed wyborem: aresztowanie lub samobójstwo i wręczyli mu rewolwer. Relacja ta zgadza się z faktem, że przeciw Ordżonikidzemu zgromadzono już pokaźne dossier. Nie daje to oczywiście żadnej pewności, że fatalny strzał padł z ręki samego Ordżonikidzego. W istocie wydaje się, że zmuszanie go do zastrzelenia się nie było konieczne, skoro enkawudziści mogli to zrobić znacznie łatwiej. Według opublikowanej niedawno relacji, strażnik, który pierwszy pojawił się w mieszkaniu Ordżonikidzego po jego śmierci, stwierdził, że na rewolwerze zabitego nie ma śladów, by z niego ostatnio strzelano i zameldował o tym (i wkrótce został rozstrzelany). Udział w całej historii Poskriobyszewa wydaje się w tej sytuacji prawdopodobny. Por R.