Druga generacja mały|iPod nano II generacji Druga generacja iPoda Nano miała miejsce 11 września 2006 roku. Nie różniła się znacząco od pierwszej generacji. Obudowa została w całości wykonana z aluminium i miała zaokrąglone boki. Nowością były nowe wersje kolorystyczne. Ta edycja miała poprawioną energooszczędność (mogła odtwarzać muzykę nawet do 24 godzin). Wyświetlacz był tych samych rozmiarów jednak 30% jaśniejszy. 13 października 2006 roku została wypuszczona na rynek czerwona wersja iPoda nano. Z każdego sprzedanego Apple przekazywało 10 USD na rzecz charytatywnej organizacji Product Red.
iPod Nano 2 Generacji był sprzedawany w 3 wersjach pojemności: 2GB 4GB 8GB (wprowadzony do sprzedaży 3 listopada 2006)
W kolorach: Czarnym (8 GB) Srebrnym Zielonym Różowym Niebieskim Czerwonym (Product Red) (wprowadzony do sprzedaży 13 października 2006)
Trzecia generacja mały|iPod nano III generacji 5 września 2007 Apple wypuściło na rynek zupełnie odświeżoną wersję iPoda nano. Już teraz nano ma 2-calowy ekran QVGA (320x240), zupełnie nowy design oraz nowe kolory. Jest jednak cięższy od poprzedników. Nowościami jest również zupełnie nowe menu, możliwość odtwarzania filmów oraz obsługa gier dostępnych przez iTunes.