Struktura Centralnemu Komitetu Żydów w Polsce podlegały komitety wojewódzkie i okręgowe. W czerwcu 1949 pod CKŻP podlegało 9 komitetów wojewódzkich, zlokalizowanych w Białymstoku, Katowicach, Krakowie, Lublinie, Łodzi, Przemyślu, Szczecinie, Warszawie i Wrocławiu oraz 7 okręgowych w Bydgoszczy, Częstochowie, Gdańsku, Olsztynie, Poznaniu, Tarnowie i Włocławku. Pod komitety wojewódzkie i okręgowe podlegały komitety powiatowe i lokalne.
Działalność W latach 1945–1950 CKŻP wydawał dziennik Dos Naje Lebn, zaś od 1947 – miesięcznik młodzieżowy Ojfgang. W latach 1946–1947 działało również wydawnictwo książkowe pod nazwą Dos Naje Lebn (później Undzer Lebn). W 1945 roku utworzono Centralną Bibliotekę Żydowską. Od sierpnia 1946 działał również Wydział Ziomkostw.
Od maja 1946 r. działał Wydział Szkolny. W roku szkolnym 1946/1947 CKŻP zdołał pod własnymi auspicjami zorganizować 28 placówek szkolnych, a w roku następnym 33 (z ok. 3000 uczniów). W szkołach CKŻP program zbliżony był do szkół publicznych. Uczono dodatkowo języka i literatury jidysz, języka hebrajskiego oraz historii Żydów. W programie nie było lekcji religii, zaś sobota była dniem wolnym. Działało również 11 sierocińców i 60 domów starców.