Religia w świecie Eberron również nie jest sprawą prostą. Panteon tego świata nie pokazuje się śmiertelnikom w sposób tak bezpośredni jak ma to miejsce w innych settingach. Istnienie magii objawień wcale nie świadczy o istnieniu bogów – kapłani, którzy wierzą raczej w konkretny system wartości a nie w danego boga również mogą otrzymywać zaklęcia. Kapłan może nawet aktywnie działać przeciw swemu kościołowi i wciąż będzie mógł rzucać czary. W rezultacie religia jest w olbrzymim stopniu zależna od wiary. W odróżnieniu od wielu innych 3-edycyjnych światów D&D kapłani nie muszą mieć charakteru różnego tylko o jeden stopień od wyznawanego przez nich bóstwa czy religii. Mogą także rzucać zaklęcia, na których użycie w innych światach nie pozwalałby im ich charakter.