100 stypendiów dla wybitnych naukowców poniżej trzydziestego roku życia oraz Nagrody Fundacji na rzecz Nauki Polskiej, finansowanie przełomowych badań realizowanych w instytucjach naukowych i firmach, wspieranie wczesnego uzyskiwania samodzielności naukowej przez młodych badaczy i zakładania przez nich zespołów badawczych, umożliwianie powstawania nowych miejsc pracy dla studentów, doktorantów i młodych doktorów, promowanie współpracy międzynarodowej polskich uczonych oraz mobilności naukowej, wspieranie innowacyjnych projektów badawczych mających potencjał komercyjny, zachęcanie polskich i zagranicznych badaczy do pracy w Polsce, wspieranie oryginalnych projektów wydawniczych, inspirowanie dyskusji poświęconych nauce, organizowanie szkoleń pomagających w rozwoju kariery naukowej, prowadzenie bieżącej ewaluacji działalności programowej.
Sposób działania Fundacji: kierowanie finansowego wsparcia bezpośrednio do naukowców i zespołów badawczych, przyznawanie wszystkich subwencji, stypendiów i nagród na zasadach konkursu, najważniejszym kryterium decydującym o przyznaniu finansowania jest doskonałość naukowa projektu, stosowanie systemu peer-review w ocenie projektów, udzielanie finansowania zgodnie z zasada "trudnego pieniądza" (wysoka konkurencyjność przy wyborze laureatów).