Ordery i odznaczenia Krzyż Komandorski z Gwiazdą Orderu Odrodzenia Polski (pośmiertnie) Krzyż Komandorski Orderu Odrodzenia Polski (8 listopada 1930)Nadany „za działalność naukową, prowadzoną z narażeniem życia”. Zarządzenie o nadaniu Wielkiej Wstęgi, Krzyża Komandorskiego z Gwiazdą i Krzyża Komandorskiego orderu Odrodzenia Polski (). Order Leopolda (Belgia) Order Świętego Grzegorza Wielkiego (Stolica Apostolska)
Upamiętnienie W 2003 został pośmiertnie odznaczony przez izraelski instytut Jad Waszem medalem Sprawiedliwy wśród Narodów Świata.
Jego imię nosi ulica we Wrocławiu (przy której mieści się Szpital Wojskowy oraz Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN) i w Poznaniu (w kierunku Collegium Stomatologicum pomiędzy dwoma budynkami Uniwersytetu Medycznego im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu: Centrum Biologii Medycznej i Centrum Kongresowo-Dydaktycznym), a także szpital w Blachowni koło Częstochowy. W 1982 jego imieniem nazwano jedną z ulic na osiedlu Górka Klasztorna w Jaśle.
Pamiątki po profesorze Weiglu (weiglana), prace naukowe, artykuły, fotografie oraz szereg przedmiotów z wyposażenia laboratorium zostały przekazane przez jego przyjaciół (w tym prof.