W jego skład wchodzi 18 poradni:

Poradnia Patologii Noworodka Poradnia Chirurgii Onkologicznej i Chorób Sutka Poradnia Diagnostyki i Leczenia Niepłodności Poradnia Genetyczna Program Badań Prenatalnych Poradnia Endokrynologii dla dzieci i dla dorosłych Poradnia Ginekologii i Chorób Menopauzy Poradnia Ginekologii Dziecięcej i Wieku Rozwojowego Poradnia Ginekologii Onkologicznej i Patologii Szyjki Macicy Poradnia Kardiologiczna dla Dorosłych z Wrodzonymi Wadami Serca Poradnia Leczenia Bólu Poradnia Metaboliczna dla dzieci i dla dorosłych Poradnia Diabetologii dla dzieci i dla dorosłych Poradnia Onkologii Klinicznej Poradnia Leczenia Osteoporozy dla dzieci i dla dorosłych Poradnia Perinatologii i Ginekologii Poradnia Położnicza i Patologii Ciąży Poradnia Wrodzonych Wad Metabolicznych u dzieci

W ramach Szpitala Ginekologiczno-Położniczego działa 11 klinik:

Klinika Chirurgii Onkologicznej i Chorób Piersi; Klinika Ginekologii Operacyjnej i Ginekologii Onkologicznej Klinika Ginekologii Operacyjnej, Endoskopowej i Ginekologii Onkologicznej Klinika Endokrynologii i Chorób Metabolicznych Pododdział Endokrynologii dla Dorosłych, Pododdział Endokrynologii Dziecięcej, Klinika Kardiologii i Wad Wrodzonych Dorosłych Pododdział Niewydolności Serca, Pracownia Badań nad Niewydolnością Serca,