W Koperniku nie ma przewodników ani ścieżek zwiedzania, każdy zwiedza we własnym rytmie i sam decyduje, w jakiej kolejności to robi. Na Wystawach pracują animatorzy (w czerwonych koszulkach), których można zapytać o to, jak działa dany eksponat i jakie zjawisko ukazuje.
Wystawy stałe Wystawy stałe to trwała część oferty Kopernika, regularnie wzbogacana o nowe eksponaty. Strefa eksperymentowania W kwietniu 2018 roku zmieniono koncepcję wystaw i otwarto Strefę Eksperymentowania w nowej odsłonie. Jest to ogromna, otwarta przestrzeń zajmująca większą część pierwszego piętra Kopernika, poświęcona człowiekowi i przyrodzie. Można tu samodzielnie eksperymentować przy ponad 200 eksponatach. Czeka tu także robot Mikołaj Kopernik, który odpowiada na pytania zwiedzających wykorzystując do tego sztuczną inteligencję
W części skupiającej zjawiska fizyczne znajdują się eksponaty związane z falami, prądem, płynami czy zjawiskami chaotycznymi. Można udać się na spacer z żyroskopową walizką czy zbudować magnetyczny most.