Budynek dworca z 1905 roku przetrwał jedynie do początku I wojny światowej – uległ znacznym zniszczeniom przez cofające się wojska rosyjskie. Stacja ponownie została uruchomiona do użytku jeszcze podczas okupacji niemieckiej, a w dniu 11 listopada 1918 r. została zajęta przez Polaków. Pół roku później, 27 maja 1919 r. na kaliskim dworcu Józef Piłsudski spotkał się z gen. Józefem Dowborem-Muśnickim i gen. Józefem Hallerem, a efektem tych rozmów było utworzenie Wojska Polskiego pod dowództwem przyszłego Marszałka Polski. W 1922 roku, po wybudowaniu linii kolejowej Kutno – Strzałkowo, która skróciła przejazd z Warszawy do Poznania, znaczenie dworca w Kaliszu jako węzła komunikacyjnego zmalało.
W 1933 roku wyremontowano i przebudowano budynek, gdzie zmieniono układ pomieszczeń. Kolejna duża inwestycja z nim związana miała miejsce w latach 1952-1955. Przeprowadzono wtedy generalny remont wraz z wymianą dachu. Dzisiejszy wygląd dworca kolejowego jest efektem przeprowadzonej w latach 2012-2015 gruntownej modernizacji.