Wskazania do przeszczepienia Choroby nowotworowe: ostra białaczka szpikowa w pierwszej remisji (przeszczepienie allogeniczne u chorych z wysokim ryzykiem i autogeniczne u chorych z ryzykiem standardowym), kolejne remisje (przeszczepienie allogeniczne) ostra białaczka limfoblastyczna w pierwszej remisji (przeszczepienie autogeniczne u chorych z wysokim ryzykiem i allogeniczny u chorych z bardzo wysokim ryzykiem), kolejne remisje (przeszczepienie allogeniczne) przewlekła białaczka szpikowa jako element leczenia pierwszej linii (pierwsza faza przewlekła) u młodszych pacjentów (tylko allogeniczne) chłoniak Hodgkina nawrotowy lub oporny na leczenie (tylko autogeniczne) chłoniaki nieziarnicze o agresywnym przebiegu (np. DLBCL) w wypadku wznowy lub oporności na leczenie (przeszczepienie autogeniczne) szpiczak mnogi jako element leczenia pierwszej linii u młodych pacjentów (przeszczepienie autogeniczne) zespoły mielodysplastyczne (tylko przeszczepienie allogeniczne) guzy zarodkowe oporne na leczenie lub nawrotowe (tylko przeszczepienie autogeniczne)
Inne wskazania hematologiczne (tylko przeszczepienie allogeniczne): ciężka postać anemii aplastycznej nocna napadowa hemoglobinuria mielofibroza (samoistne zwłóknienie szpiku) talasemia ciężka postać niedokrwistości sierpowatokrwinkowej