Organizacja uczestniczy także w badaniach nad odbiorem i skutecznością reklamy społecznej, współpracując z ośrodkami naukowymi i ekspertami z zakresu psychologii społecznej, socjologii i komunikacji marketingowej.

Współpraca z Fabryką Komunikacji Społecznej Profesjonalne przygotowywanie strategii komunikacji i realizację kampanii społecznych na zlecenie innych podmiotów fundacja powierza agencji Fabryka Komunikacji Społecznej, utworzonej przez osoby związane z FKS. Agencja ta jest stałym sponsorem Fundacji i finansuje m.in. koszty biura, przy czym oba podmioty pozostają odrębnymi jednostkami prawnymi.

Struktura i nadzór Zarząd Fundacji stanowi organ reprezentujący organizację na zewnątrz. Zgodnie z aktualnym wpisem w KRS oświadczenia woli w imieniu fundacji składają prezes lub wiceprezes zarządu. Prezesem zarządu od momentu rejestracji pozostaje Paweł Michał Prochenko, a funkcję wiceprezesa pełni Ireneusz Stankiewicz (stan na 2022 rok). Organem nadzoru jest rada fundacji, w której skład wchodzą m.in. Olga Figurska i Olga Lasota. Nadzór nad działalnością FKS sprawuje minister właściwy do spraw rodziny i polityki społecznej.