Czysta woda z wapiennych źródeł pochłania promienie czerwone, a przepuszcza odbite od dna niebieskie i zielone, które można obserwowaćWedług informacji na tablicy informacyjnej :Plik:Blue Sources Nature Reserve in Tomaszow Mazowiecki - 06.jpg..
Temperatura wody w miejscach wypływu wynosi około 9 °C, w otaczającym je akwenie waha się od 6 °C zimą do 11 °C latem. Wydajność wód wynosi obecnie 80 l/s i jest znacznie niższa niż kiedyś, na co duży wpływ miała działalność człowieka.
Flora i fauna Na terenie rezerwatu występuje prawie 400 gatunków roślin, około 75% z nich to gatunki pospolite. Do rzadko spotykanych w tej części kraju gatunków należą: wierzba czarniawa, rzeżucha niecierpkowa, turówka wonna, grzybienie białe oraz paprocie – nasięźrzał pospolity i nerecznica grzebieniasta. Roślinność wodna jest za to uboga, co związane jest głównie z warunkami termicznymi wywierzysk. Oprócz tego w rezerwacie rosną: ziarnopłon wiosenny, bluszczyk kurdybanek, podagrycznik pospolity i czeremcha zwyczajnaPraca zbiorowa, Przewodnik turystyczny po przyrodniczej ścieżce dydaktycznej w rezerwacie Niebieskie Źródła, Towarzystwo Ochrony Krajobrazu, Łódź, 2010 (folder turystyczny)..