Federacja, obawiając się, że inwazja jest nieuchronna, zaminowała bajorański tunel podprzestrzenny, zapobiegając dalszym ruchom okrętów Dominium z Kwadrantu Gamma. Siły Dominium już znajdujące się w Kwadrancie Alfa odpowiedziały napaścią na Deep Space 9. Jako kontratak, siły Federacji i Klingonu zniszczyły stocznie statków kosmicznych Dominium na Torros III. Mimo zablokowania tunelu podprzestrzennego, siły Dominium zdołały wyrządzić spore straty siłom Federacji i Klingonu, w początkowych miesiącach 2374 r. Największe straty poniosła Gwiezdna Flota w systemie Tyra, gdzie okręty Jem'Hadar zniszczyły 98 okrętów Federacji. Potęga Kwadrantu Alfa została silnie załamana do czasu, gdy Gwiezdne Imperium Romulan zerwało pakt o nieagresji z Dominium. Szala zwycięstwa powoli zaczęła przechylać się na stronę Kwadrantu Alfa po zmasowanym ataku Romulan, Federacji i Klingonów na system Chin'toka, który został wyrwany spod kontroli Kardasjan. Pomimo to, wsparte przez siły od zawsze wrogo nastawionej do Federacji (i innych potęg Kwadrantu Alfa) cywilizacji Breen, Dominium przemogło potęgi Kwadrantu Alfa, mimo że śmiercionośny wirus, wyhodowany przez naukowców Federacji rozprzestrzeniał się wśród populacji Założycieli i groził im wyniszczeniem.