Dowódca 2 Korpusu OPL OK w Bydgoszczy – 27.10.1957 – 07.1961 Zastępca dowódcy Wojsk Lotniczych i OPL OK ds. Szkolenia w Warszawie – 02.08.1961 – 03.07.1962 Zastępca Generalnego Inspektora Lotnictwa ds. szkolenia w Warszawie – 04.07.1962 – 12.07.1963 Cz. po. Głównego Inspektora Lotnictwa w Warszawie – 13.07.1963 – 07.11.1963 thumb|Grób gen. Michała Jakubika na Cmentarzu Wojskowym na Powązkach w Warszawie
W latach 1961–1965 radny Wojewódzkiej Rady Narodowej w BydgoszczyDziennik Urzędowy Wojewódziej Rady Narodowej w Bydgoszczy, nr 4, 18 kwietnia 1961, s. 1.. 29 kwietnia 1966 w związku z pogarszającym się stanem zdrowia przeszedł do dyspozycji MON. Zmarł 28 października 1966 w Łodzi. Pochowany na Cmentarzu Wojskowym na Powązkach w Warszawie (kwatera A14-1-16). W imieniu Wojska Polskiego przemówienie pożegnalne wygłosił Główny Inspektor Lotnictwa gen. Jan Raczkowski.
Był zasłużonym wychowawcą kadr lotnictwa i jednym z pionierów PRL-owskiego lotnictwa wojskowego, a także pierwszym w PRL pilotem z polskim obywatelstwem awansowanym na stopień generalski.