Tyberium Tajemniczy pierwiastek stanowi jeszcze większą zagadkę niż w czasie Pierwszej Wojny Tyberiańskiej – duże połacie terenu, w szczególności położonego w strefach zwrotnikowych i umiarkowanych, są stopniowo transformowane w tereny nie nadające się do zamieszkania przez ludzi ani żadne inne organizmy oparte na związkach węgla, a na których pojawiają się nowe gatunki, takie jak Diabeł Tyberiański (Tiberian Fiend – istota zbliżona rozmiarami do byka, na wzór jeżozwierza zdolna bronić się lub atakować za pomocą odłamków Tyberium, które pokrywają grzbiet owej istoty. Dysponuje dość dużą inteligencją, czego dowodem jest możliwość przynajmniej częściowego oswojenia go i używanie w charakterze psa strażniczego przez frakcję Zapomnianych), Tiberian Riparius i Tiberian Vinifera (powstałe przypuszczalnie z mutacji ziemskich roślin, odpowiedzialne za ekspansję Tyberium), Visceroidy (bezkształtne organizmy, wrogo nastawione do otoczenia, powstałe w wyniku bliżej nieokreślonej mutacji ludzkiej tkanki), Żyły Tyberiańskie (organizm, rozprzestrzeniający się na sąsiadujące tereny przy pomocy specyficznych "odnóży", które służą też do podawania pokarmu do centralnej "jamy gębowej", będącej jedynym wrażliwym na ostrzał elementem istoty) oraz istota, zwana Tiberium Floaterem – unoszący się nad ziemią organizm, absorbujący i powoli trawiący