W 1999 roku rozpoczęto tzw. „bój o eter”, czyli starania o koncesję niezbędną do emisji drogą radiową. Nadzieje na jej otrzymanie rozbudzał fakt, że w tamtym czasie swoje nadawanie rozpoczęło aż pięć rozgłośni studenckich. Niestety Krajowa Rada Radiofonii i Telewizji nie przydzieliła stacji koncesji. W 2000 roku w radiu zainstalowano komputery, które podłączono do Miejskiej Sieci Komputerowej TORMAN, a w swoje piąte urodziny, 27 listopada 2001 roku, Sfera rozpoczęła nadawanie w InternecieM. Nowak, Działalność studenckich rozgłośni w mediach społecznościowych na przykładzie Radia Sfera, Radia Żak i Radia Afera, praca licencjacka UMK, nr albumu: 281909, Toruń, 2015 rok, s. 14..
W 2000 roku, w ramach Radia Sfera wyodrębniono Eksperymentalne Studio Form Dźwiękowych – Sferaks, dziś znane pod skróconą formą SferaX.
Radio Sfera zostało wyróżnione Srebrnym Medalem Wielkiej Orkiestry Świątecznej Pomocy.
Władze Redaktorem naczelnym jest Robert Górecki. Wcześniej tę funkcję sprawowała Oliwia Ciszewska (2019–2022), Stanisław Janowski (2018–2019), Patryk Przybyłowski (2016–2018), Bartosz Chodorowski (2013–2016), Marcin