Uchodził za kandydata do literackiej Nagrody Nobla.
Zmarł w nocy z 19 na 20 kwietnia 1983. Został pochowany na cmentarzu Powązkowskim w Warszawie (kwatera 170-3-7). thumb|upright|Grób na cmentarzu Powązkowskim w Warszawie Życie prywatne Andrzejewski był osobą biseksualną; dwukrotnie żonaty, utrzymywał jednak intymne związki z mężczyznami. Pierwsze małżeństwo zawarł w 1934 z Noną Barbarą Siekierzyńską, drugie – w 1946 z Marią Abgarowicz, z którą miał syna Marcina (ur. 25 września 1943), dla którego w latach 1943–1945 prowadził dziennik Zeszyt Marcina (1994), córkę Agnieszkę Eugenię (ur. 19 listopada 1946, zm. 7 maja 2021), redaktorkę i tłumaczkę, oraz syna Janusza Andrzejewskiego (ur. 17 listopada 1955).
W latach 60. był związany z młodszym o 37 lat tancerzem zespołu „Mazowsze” Markiem Kellerem. Za miłość swojego życia Andrzejewski uznawał Krzysztofa Kamila Baczyńskiego, którego zdjęcie do końca życia trzymał na półce. Po śmierci Baczyńskiego w powstaniu, którą Andrzejewski ciężko przeżył, zakochał się w Marku Hłasce. Temat homoseksualności od początku był w kręgu jego zainteresowań literackich. Związki homoseksualne były także jednym z tematów jego korespondencji, a także prowadzonego przez niemal całe życie intymnego dziennika, który nie ukazał się drukiem, a jego fragmenty uległy rozproszeniu.