Kompozycja Instrumentacja „’03 Bonnie & Clyde” obejmuje programowaną perkusję, instrumenty basowe, a także gitarę flamenco. Ethan Brown z magazynu New York uznał, że dźwięki gitary flamenco przypominają utwór „Fiesta”, który w 2001 roku Jay-Z nagrał wraz z R. Kellym. Piosenka sampluje beaty ścieżki „Me and My Girlfriend” rapera Tupaca Shakura. Z kolei część wersów, które śpiewa Beyoncé zaczerpnięta zostały z utworu „If I Was Your Girlfriend” Prince’a. "’03 Bonnie & Clyde” inspirowany był dramatem gangsterskim Bonnie and Clyde (1967)"The Ultimate 90 – Bonnie and Clyde", w: Vibe, InterMedia Partners. [dostęp: 2012-01-14]; Jay-Z i Knowles przedstawieni są jako współczesna wersja tego duetu przestępców"Changing the Game", w: Vibe, InterMedia Partners. [dostęp: 2012-01-14]. Ponadto, raper odnosi się w tekście do związku Bobby’ego Browna i Whitney Houston, a także serialu telewizyjnego Seks w wielkim mieście.