Pierwszym pociągiem na ponownie otwartej Warszawie Głównej dnia 14 marca 2021 r. był pociąg Łódzkiej Kolei Aglomeracyjnej nr 91101 relacji Łódź Fabryczna – Warszawa Główna.
W lipcu 2022 roku oddano do użytku czteroprzęsłową, 193,25-metrową zadaszoną kładkę nad stacją, łączącą Aleje Jerozolimskie i ulicę Kolejową, umożliwiającą dostęp na perony. Jej projektantami byli Andrzej Kasprzak i Tomasz Michnowicz. Kładka ma konstrukcję stalową, kratownicową, z kształtowników zamkniętych, prostokątnych. Zaprojektowano kratownicę o zmiennej wysokości (od 3,0 do 5,0 m w osi pasów) i szerokości 7,24 m (przy szerokości chodników 6 m). Pomost jest żelbetowy, zespolony z poprzecznicami, betonowany na traconej blasze trapezowej. Konstrukcję przęseł wykonano w układzie ciągłym, czteroprzęsłowym, opartym na żelbetowych podporach słupowych. Największe przęsło (zlokalizowane od strony Al. Jerozolimskich) ma 51 m, a pozostałe trzy odpowiednio 2 x 46,7 m oraz 47,5 m. Dostęp do poziomu pomostu odbywa się poprzez schody i windy, zlokalizowane na obu jej końcach oraz na peronach stacji. Ze względu na koszty zamknięć ruchu kolejowego zdecydowano o montażu konstrukcji stalowej z wykorzystaniem metody nasuwania wzdłużnego. Konstrukcję scalano „segment po segmencie” od jednej strony, ze stanowiska zlokalizowanego za podporą przy ul. Towarowej.