Powodem było żydowskie pochodzenie oraz swawolny tryb życia i częste sięganie po alkohol.
W 1918 roku ich przyjaciel Leopold Zborowski pomógł im opuścić Paryż. 29 listopada 1918 roku w Nicei Jeanne urodziła córkę, którą nazwała tym samym imieniem – Jeanne Modigliani (1918–1984). Zdrowie Modiglianiego pogarszało się – chorował na gruźlicę. Para ciągle borykała się z problemami finansowymi. Prace Modiglianiego nie sprzedawały się zbyt dobrze, w dodatku zarobione pieniądze często przepijał. Zimą 1919 roku stan jego zdrowia znacznie się pogorszył. Amedeo zmarł 24 stycznia 1920 roku. Dwa dni później Jeanne rzuciła się z piątego piętra i popełniła samobójstwo w ostatnim miesiącu ciąży. Po śmierci rodziców w 1920 Jeanne Modigliani (zm. 1984) była wychowywana we Florencji przez siostrę Amedea Modiglianiego. Została historyczką sztuki.
Rodzina Jeanne obarczyła Modiglianiego śmiercią córki. Pochowano ją na Cimetière de Bagneux. Prawie 10 lat później, rodzina Hébuterne w końcu ustąpiła i pozwoliła przenieść szczątki Jeanne na cmentarz Père Lachaise, by mogła spocząć obok Modiglianiego.