441–443, Warszawa 1939-1948..
Znaczenie Jakkolwiek niektóre jego tezy zostały odrzucone przez współczesną etnologię i historiografię, to jego kontrowersyjna teoria o niesłowiańskim pochodzeniu Rosjan wywarła wpływ na dyskurs naukowy drugiej połowy XIX wieku. Krytycy zarzucali mu antyrosyjskie zaślepienie, które nie pozwalało mu zauważyć niektórych przesłanek źródłowych, zarzucano mu też, że jego praca naukowa nosi znamiona propagandy politycznejWacław Nałkowski: O geograficznych błędach, na których opierają się historiograficzne poglądy profesora Duchińskiego. Warszawa 1881; Jan Niecisław Baudouin de Courtenay: Z powodu jubileuszu profesora Duchińskiego Kraków 1886.. Zwolennicy podnosili jego wielki wkład we wprowadzenie do dyskursu naukowego kwestii odrębności dziejów Rusi Kijowskiej i państwa moskiewskiegoAgaton Giller: O życiu i pracach Franciszka Henryka Duchińskiego kijowianina. Lwów 1885.. Niewątpliwie działalność publicystyczna Duchińskiego spowodowała, niechętne przyjęcie przez zachodnioeuropejską opinię publiczną idei panslawizmu, popieranego przez Rosję.