Po ukończeniu Seminarium w 1925 roku pojechał na kurs zastępowych zorganizowany w Mszanie, gdzie złożył przyrzeczenie harcerskie. 1 kwietnia 1927 roku Komenda Chorągwi Śląskiej mianowała Józefa Pukowca komendantem Hufca Rybnik, ponieważ dotychczasowego hufcowego powołano do służby wojskowej. Prowadził szkolenia i kursy harcerskie. 26 sierpnia 1939 roku został mianowany komendantem Chorągwi Śląskiej
Od października 1939 organizował tajne harcerstwo na Śląsku. Był członkiem władz naczelnych harcerstwa polskiego, członkiem sztabu konspiracyjnej organizacji − Polskie Siły Zbrojne, współredagował konspiracyjne pisma śląskie. Gestapo aresztowało Pukowca 18 grudnia 1940 wraz z wielu innymi działaczami polskimi. Więziony w Katowicach, Berlinie, Gliwicach i Oświęcimiu. Został zgilotynowany w katowickim więzieniu przy ulicy Mikołowskiej.
Decyzją Rady Państwa PRL z sierpnia 1982 roku został pośmiertnie odznaczony medalem „Za udział w wojnie obronnej 1939”Jerzy Klistała: Józef Pukowiec. Wzór cnót harcerskich tysol.pl [dostęp 2025-01-26].
Jego imię nosi jedna z ulic w Katowicach, Rudzie Śląskiej, Rybniku i Pawłowicach, a także Szkoła Podstawowa nr 4 na osiedlu Daszyńskiego w Pszczynie, Gimnazjum nr 4 w Gliwicach, Gimnazjum nr 3 w Rybniku oraz Szkoła Podstawowa nr 2 w Pawłowicach.