Na terenie Rezerwatu Góra Radunia stwierdzono 10 gatunków paprotników (2 gatunki skrzypów i 8 gatunków paproci), 183 gatunki nasiennych (5 gatunków szpilkowych, 134 gatunki dwuliściennych i 44 gatunki jednoliściennych).
paprotniki Pteridophyta skrzypy Sphenopsida
skrzypowce Equisetales skrzypowate Equisetaceae skrzyp leśny Equisetum sylvaticum skrzyp łąkowy Equisetum pratense
paprocie Filicopsida paprotnikowce Filicales orlicowate Hypolepidaceae orlica pospolita Pteridium aquilinum zanokcicowate Aspleniaceae zanokcica północna Asplenium septentrionale zanokcica skalna Asplenium trichomanes zanokcica klinowata Asplenium cuneifolium paprotnikowate Aspidiaceae nerecznica samcza Dryopteris filix-mas nerecznica krótkoostna Dryopteris carthusiana nerecznica szerokolistna Dryopteris dilatata paprotkowate Polypodiaceae paprotka zwyczajna Polypodium vulgare
nasienne Spermatophyta szpilkowe Pinopsida
szpilkowce Pinales sosnowate Pinaceae jodła pospolita Abies alba daglezja zielona Pseudotsuga menziesii świerk pospolity Picea abies modrzew europejski Larix decidua Sosna zwyczajna Pinus sylvestris
dwuliścienne Dicotyledones wierzbowce Salicales wierzbowate Salicaceae wierzba iwa Salix caprea topola osika Populus tremula