W sezonie 1978/1979 dotarł do finału Pucharu Francji, w którym ulegli po dogrywce na Parc des Princes w Paryżu z FC Nantes 4:1, a w sezonie 1979/1980 uzyskał historyczny awans do Première Division i od tego momentu AJ Auxerre zaczął odnosić sukcesy w krajowych i europejskich rozgrywkachThe epic life and legacy of Guy Roux, the man who managed Auxerre for 44 years [data dostępu: 2019-12-06] . Zespół pod wodzą Rouxa zdobył w sezonie 1995/1996 pierwsze w swojej historii mistrzostwo Francji, czterokrotnie zajął 3. miejsce w Première Division (1984, 1991, 1994, 2002), czterokrotnie zdobył Puchar Francji (1994, 1996, 2003, 2005), dotarł w sezonie 1992/1993 do półfinału Pucharu UEFA, w którym ulegli niemieckiej Borussii Dortmund (0:2, 2:0 k. 5:6), triumfował w Pucharze Intertoto 1997 po pokonaniu w finale z niemieckim MSV Duisburg (0:0, 2:0) oraz w sezonie 1999/2000 dotarł do finału tych rozgrywek, jednak w finale ulegli niemieckiemu VfB Stuttgart (0:2, 1:1), a także dwukrotnie zdobywał Coppa delle Alpi (1985, 1987)Five longest serving football managers of all time [data dostępu: 2017-01-16] .