W tym czasie w Polanicy-Zdroju zbudowano przystanek osobowy dla obsługi podróżnych i niewielkiego ruchu towarowego. Do tego celu służył dworzec z poczekalnią i małym magazynem. 15 listopada 1890 wjechał tu pierwszy pociąg. Liczba podróżnych, którzy odwiedzali uzdrowisko w Polanicy-Zdroju, zwiększała się z roku na rok, dlatego w latach 1914–1918 postanowiono przebudować stację. W tym czasie wybudowano część towarową stacji, m.in.: wagę, rampę ładunkową i plac ładunkowy, dobudowano 3. tor dla zwiększenia możliwości mijania się pociągów oraz wydłużono perony z 50 do 250 m..
Po II wojnie światowej i przejęciu ziemi kłodzkiej przez Polskę w maju 1945 przemianowano stację na Wrześniów (miastu nadano nazwę Puszczyków Zdrój). W maju 1946 r. Komisja Ustalania Nazw Miejscowości ustaliła nazwę Polanica-ZdrójHenryk Grzybowski, Zagadka nazwy Altheide/Polanica w: Polanica Zdrój wczoraj i dziś, tom I, s. 41–43; Nowa Ruda-Polanica Zdrój 2006, ..
Obecnie w budynku dworca funkcjonuje poczekalnia dla podróżnych w dawnym holu kasowym. Kasa jest nieczynna. Stacja nie spełnia już funkcji towarowych, a wjazd na teren części towarowej jest zablokowany urządzeniami technicznymi.