Biblioteka Polsko-Amerykańskiego Instytutu Pediatrii CM UJ w Krakowie rozpoczęła swoją działalność 1 stycznia 1966 roku.
Początki Zalążkiem obecnego księgozbioru były książki i czasopisma medyczne ze zbiorów Biblioteki Uniwersytetu Jagiellońskiego (873 książki i 65 tytułów czasopism) oraz Biblioteki II Kliniki Chorób Dzieci Akademii Medycznej (177 książek).
Cennym nabytkiem dla biblioteki było dzieło Cualtera Harrisa De morbis acutis infantum, wydane w 1689 roku. Dzieło to wraz z innymi eksponatami można obecnie oglądać w muzeum, którym opiekują się pracownicy biblioteki (muzeum to znajduje się na terenie Instytutu). Biblioteka IP jest biblioteką naukową specjalną tzn. gromadzi literaturę głównie z zakresu pediatrii oraz w mniejszym zakresie z innych działów medycyny i nauki.
O zakresie gromadzonych w bibliotece zbiorów decydują również praktyczne potrzeby czytelników – głównie pracowników Instytutu, a także studentów, lekarzy-stażystów i innych osób.
Źródła zbiorów Swoje zbiory biblioteka otrzymuje poprzez: zakupy i dary z Biblioteki Głównej CM UJ zakupy z Instytutu Pediatrii CM UJ dary z Fundacji Project HOPE wymianę międzybiblioteczną dary prywatnych osób