Wyróżnia się następujące jądra wzgórza:
Nazwa jądra/grupy jąder Impulsacja aferentna Impulsacja eferentna Główna funkcja Przynależność Jądra przednie ciała suteczkowate (pęczek suteczkowo-wzgórzowy), podwzgórze, hipokamp, kora zakrętu obręczy (pęczki korowo-wzgórzowe) zespalają czynność hipokampa, podwzgórza oraz kory zakrętu obręczy układ limbiczny Jądro przyśrodkowe kora przedczołowa położona od przodu od kory ruchowej (piramidowej) i przedruchowej (pozapiramidowa), układ limbiczny, podwzgórze (część boczna i pole przedwzrokowe) wyrażanie afektów i emocji; czynność behawioralna układ limbiczny, układ pozapiramidowy Jądro brzuszne przednie ciało prążkowane, twór siatkowaty, niespecyficzne jądra wzgórza, móżdżek (głównie jądro zębate), kora ruchowa i przedruchowa prążkowie, kora ruchowa i przedruchowa związek z motoryką pośrednie móżdżek (jądro zębate), jądro czerwienne, gałka blada, jądra przedsionkowe (lemniscus vestibularis), kora ruchowa i przedruchowa kora ruchowa i przedruchowa wpływa na układ somatyczny odśrodkowy przez układ pozapiramidowy i móżdżek układ pozapiramidowy tylno-przyśrodkowe wstęga trójdzielna, włókna smakowe z jądra pasma samotnego kora czuciowa i smakowa przekazywanie wrażeń czuciowych (bólu i temperatury oraz różnicowanie dotyku) z twarzy oraz informacji smakowych tylno-boczne wstęga przyśrodkowa,